Заказчиком и координатором работ по созданию ЕГАСКРО выступал Комитет Российской федерации по охране окружающей среды, а в последствии Министерство природных ресурсов Российской Федерации. В 2000 году Правительство Российской федерации постановлением от 22 февраля утвердило федеральную целевую программу «Ядерная и радиационная безопасность России» на 2000 – 2006 года, в которую в качестве подпрограммы (пункт 10) включены мероприятия по созданию ЕГАСКРО.

Практические шаги по реализации ФЦП «Создание Единой государственной автоматизированной системы контроля радиационной обстановки на территории Российской Федерации» начались с 1997 года после разработки и утверждения 12 августа 1997 года Председателем Государственного комитета по охране окружающей среды В.И. Даниловым-Данильяном документа «Общего технического задания на создание Единой государственной автоматизированной системы контроля радиационной обстановки на территории Российской Федерации».

Данный документ определил основные функции, структуру и состав ЕГАСКРО и принципы построения системы. Основным принципам построения ЕГАСКРО является объединение в качестве подсистем ЕГАСКРО существующих ведомственных систем автоматизированного контроля радиационной обстановки.

Госатомнадзор России входит в состав ЕГАСКРО в качестве информационно аналитической службы, основной задачей которой является получение и использование для деятельности Госатомнадзора России информации накапливаемой в ЕГАСКРО.

В 1997 году Госатомнадзору России было выделено финансирование в сумме 53,5 млн. неденоминированных рублей на разработку частного технического задания на развитие автоматизированной системы информационно аналитической службы Госатомнадзора России в составе ЕГАСКРО.

МТОИЗИ совместно с 4 управлением разработало частное техническое задание на развитие автоматизированной системы информационно аналитической службы Госатомнадзора России в составе ЕГАСКРО.

В 2000 году МТОИЗИ Госатомнадзора России подписал соглашение между Государственным институтом прикладной экологии и МТОИЗИ Госатомнадзора России о проведении совместных работ по созданию и сопряжению абонентского пункта информационно аналитического центра Госатомнадзора России и с федеральным информационно аналитическим центром ЕГАСКРО. Для проведения данных работ было выделено финансирование в размере 40 тысяч рублей.

МТОИЗИ совместно с 4 управлением был разработан временный регламент обмена информацией между информационно- аналитическим центром Госатомнадзора России и экспериментальным участком ЕГАСКРО в ФИАЦ и инструкция оператора временного абонентского пункта ЕГАСКРО, определены программно технические средства.

В качестве физической среды для передачи информации использовались коммутируемые телефонные линии связи.

В течении 2001 года проводилась опытная эксплуатация экспериментального участка. Еженедельно проводился обмен информацией с управляющим центром экспериментального участка (Государственный институт прикладной экологии МПР России.) В декабре 2001 года было проведено аварийное учение по отработке процедуры оповещения участников ЕГАСКРО о радиационной аварии и переводе информационной структуры федерального уровня ЕГАСКРО в режим повышенной готовности и аварийный режим функционирования. Учения прошли успешно. Сбоев в работе программных и технических средств не зафиксировано.

С 2002 по настоящее время финансирование работ по наращиванию функциональности и расширению экспериментального участка ЕГАСКРО проводилось в ограниченном объеме. Финансирование работ Госатомнадзора России по развитию автоматизированной системы информационно аналитической службы Госатомнадзора России в составе ЕГАСКРО не проводилось.